Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms