Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap44Q5SSM3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms