Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RilpQ5ND29 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms