Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms