Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtl5Q5DTT4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtl5Q5DTT4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms