Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms