Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3lQ4KL14 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms