Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms