Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Garnl3Q3V0G7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms