Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp48Q3V0C5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Usp48Q3V0C5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp48Q3V0C5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Usp48Q3V0C5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp48Q3V0C5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Usp48Q3V0C5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp48Q3V0C5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp48Q3V0C5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp48Q3V0C5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp48Q3V0C5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp48Q3V0C5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp48Q3V0C5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp48Q3V0C5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp48Q3V0C5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp48Q3V0C5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Usp48Q3V0C5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp48Q3V0C5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp48Q3V0C5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp48Q3V0C5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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