Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc160Q3UYG1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc160Q3UYG1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc160Q3UYG1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc160Q3UYG1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc160Q3UYG1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccdc160Q3UYG1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccdc160Q3UYG1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccdc160Q3UYG1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccdc160Q3UYG1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccdc160Q3UYG1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccdc160Q3UYG1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ccdc160Q3UYG1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc160Q3UYG1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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