Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28047Q3US59 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms