Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms