Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrc4Q3UP24 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms