Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Skap2Q3UND0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Skap2Q3UND0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms