Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hdgfl2Q3UMU9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms