Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ceacam12Q3UKP4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms