Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm648Q3UJ22 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm648Q3UJ22 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm648Q3UJ22 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm648Q3UJ22 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Gm648Q3UJ22 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm648Q3UJ22 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm648Q3UJ22 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm648Q3UJ22 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm648Q3UJ22 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm648Q3UJ22 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm648Q3UJ22 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm648Q3UJ22 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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