Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rnf224Q3UIW8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Rnf224Q3UIW8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf224Q3UIW8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf224Q3UIW8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf224Q3UIW8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf224Q3UIW8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf224Q3UIW8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf224Q3UIW8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf224Q3UIW8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf224Q3UIW8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf224Q3UIW8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rnf224Q3UIW8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms