Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod2Q3UHZ5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmod2Q3UHZ5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms