Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms