Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms