Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gtpbp6Q3U6U5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
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Gtpbp6Q3U6U5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
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Gtpbp6Q3U6U5 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Gtpbp6Q3U6U5 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Gtpbp6Q3U6U5 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Gtpbp6Q3U6U5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Mterf1a-201ENSMUST00000044746 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Gtpbp6Q3U6U5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Gtpbp6Q3U6U5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Gtpbp6Q3U6U5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Gtpbp6Q3U6U5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Gtpbp6Q3U6U5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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