Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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