Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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