Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TQQ9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms