Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc10Q3TLI0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms