Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fubp3Q3TIX6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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