Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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