Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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