Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

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Length 525 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gbp8Q2V6D6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gbp8Q2V6D6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms