Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms