Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf3ip1Q149C2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms