Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms