Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms