Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms