Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apoc2Q05020 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc2Q05020 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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