Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox13Q04891 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms