Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms