Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms