Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms