Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mmp11Q02853 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mmp11Q02853 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp11Q02853 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms