Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfiaQ02780 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms