Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pax5Q02650 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms