Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GscQ02591 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GscQ02591 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GscQ02591 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GscQ02591 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GscQ02591 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GscQ02591 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GscQ02591 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GscQ02591 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GscQ02591 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GscQ02591 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GscQ02591 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GscQ02591 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GscQ02591 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GscQ02591 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GscQ02591 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GscQ02591 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GscQ02591 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GscQ02591 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GscQ02591 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GscQ02591 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GscQ02591 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GscQ02591 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GscQ02591 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GscQ02591 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GscQ02591 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GscQ02591 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GscQ02591 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GscQ02591 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GscQ02591 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GscQ02591 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GscQ02591 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GscQ02591 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GscQ02591 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GscQ02591 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GscQ02591 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GscQ02591 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GscQ02591 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GscQ02591 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GscQ02591 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms