Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd1Q02242 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms