Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja5Q01231 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja5Q01231 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms