Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms