Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin2bQ01097 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2bQ01097 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms