Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms